بر اساس بند ج ماده 4 قانون چگونگی اداره مناطق آزاد تجاری - صنعتی، تصویب برنامه و بودجه سازمان های مناطق آزاد بر عهده هیئت وزیران به عنوان مجمع عمومی است. بر این اساس برنامه و بودجه سازمان های مناطق آزاد مشتمل بر احکام و تبصره‌های بودجه، درآمدها و هزینه‌ها، منابع و مصارف سازمانهای مناطق طی این سند برای اجرا در سال 1386 به تصویب هیئت وزیران رسیده است.