بر اساس بند ج ماده 4 قانون چگونگی اداره مناطق آزاد تجاری - صنعتی، تصویب برنامه و بودجه سازمانهای مناطق آزاد بر عهده هیئت وزیران به عنوان مجمع عمومی است. بر این اساس برنامه و بودجه سازمانهای مناطق آزاد مشتمل بر احکام و تبصره های بودجه، درآمدها و هزینه‌ها، منابع و مصارف سازمانهای مناطق طی این سند برای اجرا در سال 1388 به تصویب هیئت وزیران رسیده است.